Secondary consensus C. Blanchet Laboratoire de Conformation des Proteines http://www.ibcp.fr/team_fpgd.html IBCP - CNRS UPR 412 7, passage du Vercors 69367 Lyon, FRANCE MPSA code : secondary sequence DPM DSC GOR4 HNNC PHD PREDA SIMPA SOPM CONS UNK_116030 UNK_116030 122 9 HETCSBGI? namelen 19 ; blocklen 60 10 20 30 40 50 60 | | | | | | UNK_116030 APADKPQVLASFTQTSASSQNAWLAANRNQSAWAAYEFDWSTDLCTQAPDNPFGFPFNTA Double Prediction cchccchehheeeccctctcchhhhhththhhhhhhhhhcccchcccccctccctcctch DSC cccccchhhhhhhccchhhhhhhhhhhhhhhccccccccccccccccccccccccccccc GOR 4 ccccccceeeeccccchhhhhhhhhhhhhhhhhheeeecccccccccccccccccccccc HNNC ccccccceeeeeccccccchhhhhhhcccchhhhhhhccccccccccccccccccccccc PHD ccccchhhhhhhhccchhhhhhhhhhhhhccccccccccccccccccccccccccccccc Predator cccccccceeecccccccchhhhhhhccccchhhhhhhcccccccccccccccccccccc SIMPA 96 ccccchhhhhhhcccccchhhhhhhhcccccceeeeccccccceeecccccccccccccc SOPM cttccchheeeecccccchhhhhhhhhtttchhhhhhhcccccccccccccccccccccc Sec. Cons. cccccchh??e?cccccchhhhhhhhhh?c?hhhhhhccccccccccccccccccccccc 70 80 90 100 110 120 | | | | | | UNK_116030 CARHDFGYRNYKAAGSFDANKSRIDSAFYEDMKRVCTGYTGEKNTACNSTAWTYYQAVKI Double Prediction hhhhccctcccchhcchtctcchechhhhhhhhheeecccctctchttccheeeeeheee DSC ccccccchhhhhhccchhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhccccchhhhhhhhhhhhhhhhhc GOR 4 cccccccccccccccccccccccchhhhhhhheeeeeeeccccceeeccccceeeeeeee HNNC cccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhhhhhecccccccccccccchhhhhhhhhe PHD cccccccccchhhccccccchhhhhhhhhhhhhhhhhccccccchhhhhhhhhhhhhhhh Predator cccccccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhhccccccccccccccchhhhhhhhc SIMPA 96 cccccccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhhccccccccccccccchhhhhhhhe SOPM cccccetccccctttccccccchhhhhhhhhhhheettccccccccccccheeeehhhee Sec. Cons. cccccccccccccccccccccchhhhhhhhhhhhh?cccccccccccccchhhhhhhhhe 130 140 150 160 170 180 | | | | | | UNK_116030 FG Double Prediction cc DSC cc GOR 4 ec HNNC cc PHD cc Predator cc SIMPA 96 ec SOPM et Sec. Cons. cc